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Formation : La donnée en biodiversité : de l’acquisition à l’ouverture
Le Cesab – Centre de synthèse et d’analyse sur la biodiversité – de la FRB, le Pôle National des Données de Biodiversité (PNDB) et GBIF France proposent la première édition de la formation « La donnée en biodiversité : de l’acquisition à l’ouverture ». Cette formation de cinq jours a pour objectif de : 1) contextualiser les enjeux autour de la compréhension, du partage et de la (ré)utilisation des données et métadonnées de biodiversité et 2) faire monter en compétences les communautés intervenant à une ou plusieurs étapes du cycle de la donnée.
Cette formation se déroule du 4 au 8 novembre 2024 dans les locaux du Cesab à Montpellier. Son prix est de 150 € pour la semaine – repas du midi inclus. Les frais de transport, d’hébergement et les repas du soir sont à la charge des participant(e)s.
Pré-programme
Cette formation est dispensée en français avec cours magistraux et travaux dirigés les quatre premiers jours ainsi que des travaux pratiques en sous-groupes le dernier jour. Une bonne maîtrise du logiciel R est requise.
Introduction et tour d’horizon
- Qu’est-ce qu’une donnée/métadonnée ?
- Grands types de données de biodiversité
- L’écosystème de la donnée en France et en recherche
- Cycle de la donnée
- Atteindre un haut degré de “FAIRitude”
- Les défis actuels (en recherche et au-delà)
Acquisition des données
- Bonnes pratiques pour une collecte de données (terrain, laboratoire, etc.)
- Accès aux données existantes (API, web scraping, text mining, etc.)
- Données brutes vs. données dérivées
Gestion des données
- Structuration (SQL, fichiers CSV, etc.)
- Traitement, nettoyage et homogénéisation
Aspects juridiques
- Partage, licences, etc.
Ouverture des données
- Plan de gestion des données
- (Méta)données : les standards
- Stockage et archivage
- Diffusion et partage
- Valorisation : le Data paper
Plus d'information
- sur le site de la Fondation pour la recherche sur la biodiversité (FRB) : présentaiton, organisation, inscription
