Services for data producers
The ODATIS Ocean Cluster federates data management and scientific expertise activities at the national level to promote and facilitate the use of oceanographic observations. ODATIS' partner centres offer guaranteed services on data management in terms of referencing, hosting, distribution and interoperability.
The challenge is therefore to define common bases for all data producers and to make datasets interoperable so that their resources are coherent, shareable, exploitable and in a multidisciplinary approach required to study the Earth system, so that the data can be combined with each other.
The ODATIS Ocean Cluster offers several services to data producers to help them to implement the FAIR principles, make data more visible and accessible by being referenced in the ODATIS catalogue, better tracked and cited via a unique identification number ("DOI") and preserved in secure warehouses (off-line archiving). These various services are summarized in the adjacent illustration and are accessible in the subpages of this section.
For any questions regarding these data management and valuation services, please use the "Contact" form.
A dataset listed in the ODATIS catalogue allows a standardised description and easy referencing by including the provision of metadata. As a data producer, you can choose if your dataset is:
- referenced in the catalogue, hosted and distributed via one of the partner centres,
- referenced in the catalogue, hosted and distributed via a partner of your choice.
The ODATIS Ocean Cluster's data catalogue offers users several data access service tools: a search engine with selection filters, a data description service, a visualization service, and a direct download service or a download via the local partners' portal (a short video shows these main features). The catalogue is directly accessible from this page.
Distribution of a dataset through the catalogue
To initiate the referencing of your dataset (observation data, derived data, maps, indicators,...), please fill in the following fields accessible from this form. The ODATIS team will then enter this information on a dedicated administration interface. A final validation step on your part will allow us to publish the metadata sheet in the ODATIS catalogue.
Hosting and Distribution of a dataset
The ODATIS Ocean Cluster offers data producers the possibility of hosting a copy of their referenced dataset via the ODATIS catalogue.
The deposit of your data files on servers can be entrusted to SEANOE (with authentication), in the case of small volume data sets with limited versions (one-shot), or to one of ODATIS' data centres and services (CDS) or to one of the partners of your choice.
In this case of hosting via ODATIS, the definition of metadata is also essential to ensure a standardized description and visibility of the data. For this purpose, we ask you to complete this form specifying your choice to host your dataset. The ODATIS team will then analyse your needs in terms of the volume required for yourdata set and, with your agreement, forward your request to the most appropriate services (SEANOE or CDS).
Data scope
The data scope disseminated and/or hosted by the ODATIS Ocean Cluster includes:
- in situ observation data, whether punctual or from collections of observation networks,
- remote sensing observation data, satellite or airborne, from processing levels L2-L3 (Level-2 and -3),
- derived data assembling L1 or L2 datasets for a particular use, variable fields from different observations (L3 and L4 products) to finally produce a dataset that can be modeled data (e. g. ocean tide), composite data (e. g. in-situ data from drifters combined with sea level data), ocean indicators, etc.
Fourniture de DOILe Pôle Océan ODATIS propose aux producteurs de données un support pour la fourniture d'un DOI pour un jeu de données marines (à différencier d'un DOI appliqué à une publication). Ce DOI correspond à un identifiant numérique propre au jeu de données, rattaché à une URL pérenne et dans lequel l'auteur (le producteur de la donnée) est identifié clairement. Cela permet une citation précise, fiable et pérenne du jeu de donnée, ainsi la donnée est plus facilement (re)trouvable et réutilisable (Findable et Reusable du principe FAIR). Le catalogue ODATIS reprend cette citation du DOI sur les fiches de métadonnée référencées. |
To begin with
The request for a DOI is made from the SEANOE or SEXTANT portal (IFREMER) or through SEDOO.
To initiate the request for a DOI, you will have to provide a list of metadata (mandatory and optional) either directly on the SEANOE portal, or via the SEXTANT portal or through this request form intended to SEDOO: author(s) of the data (name, first name of the natural or legal person, list of authors, ORCID ID), title, name of the entity that produced/financed the resource, the year the data was made available, URL of the description page...Link to the request form to SEDOO
Landing page
If a descriptive web page (commonly called a "landing page") already exists for your dataset and for which you guarantee the durability of the URL, please indicate this URL in the DOI creation form.
If such a landing page does not yet exist, the ODATIS catalogue metadata sheet, referencing your dataset, will correspond to this landing page. In the latter case, please indicate this ODATIS catalogue URL (example of an ODATIS catalogue dataset URL) in the DOI creation form.
DOI Declaration
Based on the metadata you have provided in the form, SEANOE or SEXTANT or SEDOO will then report this request to an official body (DataCite). Finally, a DOI is generated whose number is structured with a common prefix and suffix that characterizes your dataset.
This DOI number will be provided to you and you can use it for any referencing of your dataset. This DOI will also be recorded in the ODATIS catalogue metadata sheet.
Plus d'information
- Guide ANR COPiLOtE sur les identifiants pérennes (PID) et leurs recommandations dans le contexte du pôle ODATIS (DOI associé à cette publication : 10.13155/87217)
Off-line repository
The ODATIS Ocean Cluster offers data producers the possibility of archiving a dataset to store it in a secure way on an archiving platform and make it accessible to the data producer, for further studies and projects.
The same dataset existing in several versions can thus be directly accessible via the ODATIS catalogue while an earlier version can be archived in offline mode.
This archiving of the dataset has several objectives: to preserve the dataset long-term by ensuring that it maintains its integrity, to make it accessible to the authors of the data and to guarantee its readability.
We ask you to fill in the following form and specify your choice to archive your dataset. The ODATIS team will then analyse your needs and direct you to the most appropriate offline archiving service (repository).
Link to the form.
Tools and software
The ODATIS Ocean Cluster's technical expertise makes it possible to offer a set of tools and software, made available to data producers and users. These tools and software enable data to be processed, compared, extrapolated, visualized and validated so that they can be used in research publications and reports or introduced into models (long-term visualization, climate prediction, etc.).
More information on these tools and software.
HAL - cluster de calcul du CNES
Le Centre de Calcul du CNES est doté d'un ensemble d'infrastructures et de services dédiés au développement et à l'exécution d'algorithmes de calcul intensif ou de traitement de données massives. Pour le calcul, la plateforme de traitement haute performance nommée HAL est composée de plus de 12 000 coeurs de calcul et 32 cartes GPU, offrant des capacités de calculs de l'ordre de 750 000 milliards d’opérations de nombres « flottants » par seconde, soit 750 teraflops.
Cet ensemble, mis à la disposition des ingénieurs et chercheurs travaillant sur des projets spatiaux en lien avec le CNES, répond déjà aux besoins de plus d'un millier d'utilisateurs et de projets opérationnels. L'accès à cette plateforme et ses resssources est possible avec des partenaires extérieurs, et notamment pour des projets scientifiques du pôle ODATIS. Par exemple, des sessions de travaux pratiques organisées au cours d'ateliers techniques ODATIS ont bénéficié de cet accès.
Les utilisateurs peuvent s’appuyer sur un ensemble de logiciels déployés sur cette plateforme de calcul, tel Pangeo.
L'accès à HAL et ses ressources au centre de calcul du CNES est possible sur description et motivation détaillées de votre projet en lien avec ODATIS. Nous vous remercions de prendre contact via ce formulaire; en précisant dans l'objet "HAL - calcul intensif".
Plus d'information:
- sur le site du CNES : Centre de calcul
- sur le site ODATIS, présentation de P.M. Brunet lors de l'atelier technique ODATIS, en octobre 2018: Présentation du projet Datalake CNES
DATARMOR - cluster de calcul de l'Ifremer
DATARMOR est la plateforme de traitement haute performance du Pôle de Calcul et de Données pour la Mer, notamment composée d'un cluster HPC de plus de 11088 cœurs et d'une capacité de calcul de 426 Tflops.
Plus d'information
- sur le site ODATIS: présentation de Julien Meillon lors de l'atelier technique ODATIS n°13, en juin 2022 : Services DATARMOR
- sur le site du Pôle de Calcul et de Données pour la Mer: équipement, données, exemples d'utilisation, ....
Support pour un plan de gestion de données
Le Pôle Océan ODATIS propose aux producteurs de données un accompagnement pour l’élaboration et la mise en pratique d'un plan de gestion de leurs données (en anglais, DMP pour Data Management Plan). Pour toutes questions relatives au plan de gestion des données, merci d'utiliser le formulaire Contact en précisant dans le champ Sujet: "Support pour un plan de gestion de données".
Objectif du DMP : Le plan de gestion de données est un élément clé pour la mise en œuvre de bonnes pratiques de gestion et rendre les données FAIR; il permet de définir et de mettre en place les actions indispensables pour gérer les données qui vont être collectées ou produites au cours d’un projet. Ces plans de gestion des données sont de plus en plus demandés dans les appels à projets financés sur fonds publics, notamment européens.
Et concrètement, un DMP prend quelle forme ? Il s'agit d'un document de quelques pages qui décrit comment les données produites sont obtenues, décrites, documentées, protégées, partagées, disséminées et conservées, tout au long du cycle de vie du projet. Les grands thèmes suivants sont décrits : Description des données et collecte; Documentation et qualité des données; Stockage et sauvegarde pendant le processus de recherche; Exigences légales et éthiques, codes de conduite; Partage des données et conservation à long terme; Responsabilités et ressources en matière de gestion des données.
Ce document est évolutif, modifiable au cours du projet et à l'issue du projet.
Plusieurs modèles adaptés peuvent être proposés en fonction des besoins propres des producteurs de données : modèle ANR, Horizon H2020, ... Votre propre organisme de rattachement peut aussi proposer un modèle pour rédiger le DMP.
Le site DMP Opidor offre un outil d'aide à la création en ligne et affiche les DMP publics.
Exemples de DMP: Parmi les DMP qui intéressent la communauté océanographique, les DMP rédigés par l'IR ILICO pour ses 9 services d'observation sont accessibles à partir du tableau ci-dessous.
Plus d'information
- Contactez le pôle ODATIS pour toutes questions relatives au plan de gestion des données : Contact
- Une formation de l'INIST est accessible en ligne pour se préparer à la rédaction d'un plan de gestion de données : enjeux et objectifs d’un PGD, contenu et rédaction, DMP OPIDoR : un outil d’aide à la rédaction de DMP. Durée : 1h30, sans niveau pré-requis. Les supports de cette formation sont téléchargeables : Bonnes pratiques de rédaction et outils (pdf, 25 pages).
Support sur les conditions d'utilisations des données
Les jeux de données référencées par le pôle ODATIS via son catalogue de données, sont soumis à des conditions d'utilisation : droits d'accès et licence d'utilisation.
Ces conditions d'accès sont choisies par chaque producteur de données.
Le groupe de travail Interpôles incluant le Pôle Océan ODATIS encourage la mise en place de la licence Creative Commons déterminant des conditions de réutilisation des données tout en apportant une sécurité juridique aux auteurs de ces données. Plusieurs options peuvent se combiner avec les éléments suivants : attribution-paternité (votre nom est cité lors de toute utilisation), partage dans les mêmes conditions, pas de modification, utilisation non-commerciale, ...
- Domaine public, pas de droits d'auteur (CC 0)
- Attribution (CC BY)
- Attribution + Pas d’Utilisation Commerciale (CC BY-NC)
- Attribution + Pas de Modification (CC BY-ND)
- Attribution + Pas d’Utilisation Commerciale + Pas de Modification (CC BY-NC-ND)
- Attribution + Partage dans les mêmes conditions (CC BY-SA)
- Attribution + Pas d’Utilisation Commerciale + Partage dans les mêmes conditions (CC BY-NC-SA).
Toutefois, chaque producteur de données peut également définir d'autres contraintes d'accès en fonction de ses propres besoins (non-responsabilité des auteurs, embargo ou moratoire, ...).
Pour toutes questions relatives à ces conditions d'utilisation, merci d'utiliser le formulaire Contact en précisant dans le champ Sujet: "Support sur les conditions d'utilisation des données".
Support pour la mise en conformité avec les standards de format
Le format d’un jeu de données est la manière dont les données sont structurées et mises à disposition des utilisateurs et des logiciels capables de les référencer, les manipuler et les visualiser. Pour garantir l'utilisation rapide et efficace des données, il convient que ces formats répondent à des standards. Le choix du format des données répond aussi aux enjeux des principes FAIR; un fichier qui enregistre les données dans un format standard, dont les métadonnées du fichier sont bien décrites par exemple, participe à l'intéopérabilité et à la réutilisation des données (le I et le R des principes FAIR).
Un support à la définition, au formatage informatique des fichiers de données et la vérification de ces standards peut être demandé par chaque producteur de données au Pôle ODATIS. Pour définir vos besoins, nous vous demandons de bien vouloir remplir le formulaire Contact en y décrivant la structure de votre jeu de données : les données en tant que telles mais aussi la structure permettant de les stocker ainsi que les métadonnées permettant de les identifier. Merci de spécifier dans le Sujet de ce formulaire : "Support pour la mise en conformité avec les standards de format".
Plus d'information
- Formats, attributs, conventions : page dédiée sur le site ODATIS, avec lien vers le paragraphe des formats de fichiers recommandés par le pôle.
- support "Utiliser NetCDF" organisé par le SIST, paragraphes Choisir NetCDF : pour l’Interopérabilité (FAIR) et pour la Réutilisabilité (FAIR), 2024
Support pour la production de données
Les missions des Centres de Données et Services (CDS) du Pôle Océan ODATIS intègrent notamment des services d'élaboration de la donnée:
- conception et validation de méthodes innovantes pour des thématiques particulières, et l’élaboration de produits qui en dérivent,
- support via des moyens informatiques pour produire la donnée à partir des mesures et algorithme fournis par le producteur de données,
- développement d’outils généraux (analyses, modèles…) en s'appuyant sur l'expertise spécifique des CDS (voir Outils et Logiciels),
- mise en oeuvre d’activités scientifiques communes du pôle ODATIS (mise en œuvre de moyens de mesures pour des opérations de calibration et validation de produits issus de données satellitaires, modèles et méthodes ; …),
Pour toute question sur ce support, merci d'utiliser le formulaire de la page "Contact" en précisant dans le sujet "Support pour la production de données" et en spécifiant vos besoins le plus précisément possible.
Publications accessibles en ligne
Archimer, l'archive ouverte de l'IFREMER permet d'accéder gratuitement à un ensemble de publications, de thèses, d'actes de congrès et de rapports internes. Cette réalisation s'inscrit dans le mouvement international Open Access qui cherche à rendre accessible, au plus grand nombre, la documentation scientifique en la diffusant gratuitement sur le Web.
Archimer - Archive institutionnelle
Archimer vous propose un accès à des milliers de documents dans tous les domaines liés à l'étude des mers et des océans (pêche, aquaculture, écologie marine, océanographie, géologie marine, biologie marine...).
