Le PNDB organise des formations introductives à la station marine de Concarneau du 6 au 8 novembre. Le programme complet et l'inscription à l’évènement sont disponibles au lieu suivant sur le site dédié.
La première journée du 6 novembre (10h30 - 18h) sera dédiée à une introduction de type séminaire de 11h à 12h et à des formations introductives sur les sujets proposés :
- Bonnes pratiques de travail avec R, initiation à l'utilisation de git et GitHub
- Initiation à l'utilisation de Docker
- Initiation au développement d'outils Galaxy à partir de scripts R
- Initiation au développement de package conda à partir de packages R
Les journées du 7 novembre (9h-18h) et du 8 novembre (9h-14h) seront dédiés aux ateliers de travail. Les participants choisissent leurs sujets de développement sur lesquels ils souhaitent travailler durant les 2 jours et/ou les compétences et/ou envies d'aider certains pour leurs projets. Une liste de sujets "chapeaux" d'intérêt est proposée ci-dessous :
- Création de scripts R,
- Développement d'applications Shiny,
- Mise à disposition d’applications Shiny par le web (via ShinyProxy notamment),
- Création de packages conda,
- Passage de scripts R / application Shiny (ou autre) en containers,
- Développement de scripts de visualisation (notamment SIG),
- Création d'outils Galaxy depuis scripts R,
- Travail autour des métadonnées (amélioration outils, hacks, amélioration de descriptions de métadonnées) et notamment autour du standard EML (Ecological Metadata Language) et/ou compendium,
- Création de matériels de formation / tutoriels / ...
