Centre de données et services in situ SBR

Les missions d’observation de la Station Biologique de Roscoff regroupent des thématiques de biologie fondamentale, de l’étude de la biodiversité et des écosystèmes marins à différents niveaux d'intégration, du gène à l'écosystème. Ces recherches ont pour but de mieux comprendre l’évolution de la vie, ainsi que le fonctionnement des écosystèmes et l’adaptation des organismes marins face au changement global. Elles font appel aux méthodes les plus modernes de la biologie moléculaire et cellulaire, en particulier la génomique et ses corollaires, ainsi qu’aux interfaces avec les sciences de l’environnement, la chimie et les mathématiques.

La création de l'Observatoire des Sciences de l’Univers STAMAR -Stations marines- en 2020 a pour volonté la mise en place d'un CDS unique pour regrouper les activités de gestion des données des CDS-IS-SBR et CDS-IS-IMEV.

PHYTOBS-Network
Depuis sa création, le Centre de Données et Services de la Station Biologique de Roscoff est chargé de la gestion des jeux de données d’observation du phytoplancton. Il assure en particulier la bancarisation des jeux de données produits par les laboratoires CNRS et Universités, participants historiques du RESOMAR. Et ceci grâce à la base de données Pelagos développée depuis 2010 au sein de la plateforme ABiMS de la SBR en étroite collaboration avec les équipes locales.

La création puis la labellisation du réseau PHYTOBS en tant que Service National d’Observation (SNO) intégré à l’infrastructure de recherche ILICO ont élargi le périmètre des responsabilités du CDS-IS-SBR qui est également chargé de la création et de la mise en accès des jeux de données annuels du SNO. Ces derniers sont construits à partir de jeux de données issus des bases Pelagos et Quadrige. La mise en accès est réalisée en collaboration technique avec la cellule ISI de l’Ifremer.

BenthOBS
Depuis 2020, et la création du réseau élémentaire BenthOBS, le CDS-IS-SBR est chargé d’assurer la bancarisation des données produites par les laboratoires CNRS et Universités au travers d’un outil développé à façon. Comme pour PHYTOBS, le CDS a la responsabilité de la création des jeux de données périodiques et de leur mise en accès. Le réseau BenthOBS a été labellisé SNO à l’automne 2022.

Bouée ASTAN
De manière plus accessoire, le CDS-IS-SBR assure la bancarisation des données de la bouée instrumentée ASTAN et la mise à disposition d’extractions quotidiennes d’un sous-ensemble des paramètres mesurés afin qu’elles soient intégrées dans la base Coriolis au profit du SNO COAST-HF.

Outre les activités de techniques liées au développement, et au maintien en conditions opérationnelles des bases de données et des outils de bancarisation, les personnes impliquées dans le CDS-IS-SBR assurent également une activité d’assistance aux utilisateurs des communautés CNRS/Universités notamment pour l’accompagnement à la bancarisation des données.