Atelier Technique - mars 2024 - Bioinformatique

GT Coordination et Synergies 

• Animation de la communauté biodiversité de l'Institut Français de la Biodiversité (IFB); point à J+6 mois
• Schéma du cycle de vie de la donnée; la 1ère version réalisée lors de l'atelier est affichée ci-contre,
  • Travailler / enrichir ce schéma du cycle de vie de la donnée (avec données / initiatives / acteurs / SI / …)
  • Action concrète #1 : partager ce document powerpoint
  • Action #2 : enrichir ce document en mode collaboratif
  • Action #3 : réflexion pour un usage via RDMkit (Research Data Management toolkit for Life Sciences)
  • Action #4 : réunion à J+6 mois pour faire un point de mises à jour et proposer synergies
• Coordination avec les cas d'usage du groupe de travail “Méthodologies”
• Le schéma du “cycle de vie de la donnée” peut servir aux 2 groupes de travail “coordination” et “méthodologies” en séparant bien les guidelines pour remplir les 2 points de vue.
• Action : Décliner le cycle de la donnée pour chaque “facette” (1 diapo pour coordination/synergies, 1 diapo pour méthodologie, et 1 diapo par facette (1 pour IUEM))

GT Méthodologies

• Recenser les entrepôts/catalogues existants, capables d'intégrer les informations de l'échantillon, de la séquence jusqu'aux résultats d'analyses (candidats évidents : GBIF + NCBI) ; Idem pour les ontologies (OLS: Ontology Lookup Service (utilisée avec EBI-ENA) ;
• Déterminer s'il existe des lacunes pour certains types de données utilisées dans ces différentes étapes, au travers des cas d'usage (ex. Cas d'usage Ifremer, Laurent Toffin, Cas d'usage INRAE : de la levure à la chope de bière, FUTURE-OBS Jonathan Mineau ; De la collecte au vouchers, E. Artige ?).
• Une réunion en visio peut être envisagée pour approfondir/détailler le plan des actions à venir